Index

_

_data (stats_misc.resampling.BaseBootstrap attribute) (stats_misc.resampling.BasicCI attribute) (stats_misc.resampling.PercentileCI attribute) (stats_misc.resampling.StudentisedCI attribute)

A

anova_one_way() (in module stats_misc.tests)

AnovaTestResults (class in stats_misc.tests)

B

BaseBootstrap (class in stats_misc.resampling) baseline_brier_score (stats_misc.machine_learning.sksurv_utils.SurvivalModelBrierScore attribute) BasicCI (class in stats_misc.resampling) BCaCI (class in stats_misc.resampling) BCaCIResults (class in stats_misc.resampling) beta_confidence_interval() (in module stats_misc.intervals)

boot_sample (stats_misc.resampling.BCaCI property) BootCIResults (class in stats_misc.resampling) bootstrap_replicates() (in module stats_misc.resampling) bootstrap_samples() (stats_misc.resampling.BaseBootstrap method), [1] bse (stats_misc.machine_learning.firthlogist.FirthLogisticRegression property) bse_ (stats_misc.machine_learning.firthlogist.FirthLogisticRegression attribute) bss (stats_misc.machine_learning.sksurv_utils.SurvivalModelBrierScore attribute)

C

c_statistic (stats_misc.machine_learning.validation.CstatisticResults attribute) calculate_pvalue() (in module stats_misc.utils.general) calculate_pvalue_tdist() (in module stats_misc.utils.general) calibration_intercept (stats_misc.machine_learning.validation.CalibrationResults attribute) calibration_intercept_se (stats_misc.machine_learning.validation.CalibrationResults attribute) calibration_slope (stats_misc.machine_learning.validation.CalibrationResults attribute) calibration_slope_se (stats_misc.machine_learning.validation.CalibrationResults attribute) CalibrationResults (class in stats_misc.machine_learning.validation) ci_ (stats_misc.machine_learning.firthlogist.FirthLogisticRegression attribute) classes_ (stats_misc.machine_learning.firthlogist.FirthLogisticRegression attribute) coef_ (stats_misc.machine_learning.firthlogist.FirthLogisticRegression attribute) compute_power() (stats_misc.utils.general.ObservedPower method), [1] (stats_misc.utils.general.ObservedPowerChiSquare method) (stats_misc.utils.general.ObservedPowerT method) compute_power_above() (stats_misc.utils.general.ObservedPower method), [1] (stats_misc.utils.general.ObservedPowerChiSquare method) (stats_misc.utils.general.ObservedPowerT method)

compute_power_below() (stats_misc.utils.general.ObservedPower method), [1] (stats_misc.utils.general.ObservedPowerChiSquare method) (stats_misc.utils.general.ObservedPowerT method) confidence_interval (stats_misc.machine_learning.validation.CstatisticResults attribute) coverage (stats_misc.intervals.IntervalResults attribute) (stats_misc.intervals.QuantilesIntervalResults attribute) (stats_misc.machine_learning.validation.CstatisticResults attribute) (stats_misc.resampling.BCaCIResults attribute) (stats_misc.resampling.BootCIResults attribute) crit (stats_misc.utils.general.ObservedPower attribute), [1], [2] (stats_misc.utils.general.ObservedPowerChiSquare attribute), [1] cstatistic() (in module stats_misc.machine_learning.validation) CstatisticResults (class in stats_misc.machine_learning.validation)

D

data (stats_misc.resampling.BCaCI attribute) (stats_misc.resampling.BCaCI property)

decision_function() (stats_misc.machine_learning.firthlogist.FirthLogisticRegression method) df_denominator (stats_misc.tests.AnovaTestResults attribute) df_numerator (stats_misc.tests.AnovaTestResults attribute)

E

estimate_tau() (in module stats_misc.meta_analysis) evaluate() (stats_misc.machine_learning.sksurv_utils.SurvivalModelBrierScore method)

event_by_time() (in module stats_misc.machine_learning.sksurv_utils) explained_sum_squares (stats_misc.tests.AnovaTestResults attribute)

F

FirthLogisticRegression (class in stats_misc.machine_learning.firthlogist) fit() (stats_misc.machine_learning.firthlogist.FirthLogisticRegression method)

fixed_effect() (in module stats_misc.meta_analysis) format_roc() (in module stats_misc.machine_learning.validation)

G

get_brier_skill_score() (stats_misc.machine_learning.sksurv_utils.SurvivalModelBrierScore method), [1]

get_calibration() (in module stats_misc.machine_learning.validation) group_summary_ (stats_misc.machine_learning.sksurv_utils.SurvivalModelCalibration attribute)

H

heterogeneity() (in module stats_misc.meta_analysis)

HeterogeneityResults (class in stats_misc.meta_analysis)

I

i_squared (stats_misc.meta_analysis.HeterogeneityResults attribute) i_squared_ci (stats_misc.meta_analysis.HeterogeneityResults attribute) i_squared_ci_coverage (stats_misc.meta_analysis.HeterogeneityResults attribute) ibs (stats_misc.machine_learning.sksurv_utils.SurvivalModelBrierScore attribute) intercept (stats_misc.machine_learning.validation.RecalibrationResults attribute) intercept_ (stats_misc.machine_learning.firthlogist.FirthLogisticRegression attribute) interval_indices (stats_misc.intervals.QuantilesIntervalResults attribute) (stats_misc.resampling.BCaCIResults attribute) (stats_misc.resampling.BootCIResults attribute)

interval_values (stats_misc.intervals.IntervalResults attribute) (stats_misc.intervals.QuantilesIntervalResults attribute) (stats_misc.resampling.BCaCIResults attribute) (stats_misc.resampling.BootCIResults attribute) IntervalResults (class in stats_misc.intervals) invlogit() (in module stats_misc.utils.general)

J

jack_sample (stats_misc.resampling.BCaCI property)

jackknife_replicates() (in module stats_misc.resampling)

K

ks_test() (in module stats_misc.tests)

L

llf (stats_misc.machine_learning.firthlogist.FirthLogisticRegression property) llf_ (stats_misc.machine_learning.firthlogist.FirthLogisticRegression attribute) logit() (in module stats_misc.utils.general)

loglik (stats_misc.machine_learning.firthlogist.FirthLogisticRegression property) loglik_ (stats_misc.machine_learning.firthlogist.FirthLogisticRegression attribute) lower_bound (stats_misc.machine_learning.validation.CstatisticResults attribute)

M

matrix_columns (stats_misc.intervals.QuantilesIntervalResults attribute) matrix_coverage (stats_misc.intervals.QuantilesIntervalResults attribute) matrix_rows (stats_misc.intervals.QuantilesIntervalResults attribute) model (stats_misc.machine_learning.sksurv_utils.SurvivalModelBrierScore attribute) module stats_misc.intervals stats_misc.machine_learning.firthlogist stats_misc.machine_learning.sksurv_utils stats_misc.machine_learning.validation stats_misc.meta_analysis stats_misc.resampling stats_misc.tests stats_misc.utils.general

N

n_iter_ (stats_misc.machine_learning.firthlogist.FirthLogisticRegression attribute)

null_value (stats_misc.tests.TestResults attribute)

O

observed_predict_table (stats_misc.machine_learning.validation.CalibrationResults attribute) ObservedPower (class in stats_misc.utils.general)

ObservedPowerChiSquare (class in stats_misc.utils.general) ObservedPowerT (class in stats_misc.utils.general) original_estimate() (stats_misc.resampling.BaseBootstrap method), [1]

P

p_value (stats_misc.tests.AnovaTestResults attribute) (stats_misc.tests.TestResults attribute) params (stats_misc.machine_learning.firthlogist.FirthLogisticRegression property) PercentileCI (class in stats_misc.resampling) point_estimate (stats_misc.intervals.IntervalResults attribute) (stats_misc.intervals.QuantilesIntervalResults attribute) (stats_misc.tests.TestResults attribute)

predict() (stats_misc.machine_learning.firthlogist.FirthLogisticRegression method) predict_proba() (stats_misc.machine_learning.firthlogist.FirthLogisticRegression method) pvals_ (stats_misc.machine_learning.firthlogist.FirthLogisticRegression attribute) pvalues (stats_misc.machine_learning.firthlogist.FirthLogisticRegression property)

Q

q_pvalue (stats_misc.meta_analysis.HeterogeneityResults attribute)

q_statistic (stats_misc.meta_analysis.HeterogeneityResults attribute) QuantilesIntervalResults (class in stats_misc.intervals)

R

random_effects() (in module stats_misc.meta_analysis) recalibrate() (in module stats_misc.machine_learning.validation)

RecalibrationResults (class in stats_misc.machine_learning.validation) residual_sum_squares (stats_misc.tests.AnovaTestResults attribute)

S

set_score_request() (stats_misc.machine_learning.firthlogist.FirthLogisticRegression method) slope (stats_misc.machine_learning.validation.RecalibrationResults attribute) standard_error (stats_misc.machine_learning.validation.CstatisticResults attribute) (stats_misc.tests.TestResults attribute) standard_errors (stats_misc.intervals.IntervalResults attribute) stats_misc.intervals module stats_misc.machine_learning.firthlogist module stats_misc.machine_learning.sksurv_utils module stats_misc.machine_learning.validation module stats_misc.meta_analysis module

stats_misc.resampling module stats_misc.tests module stats_misc.utils.general module StudentisedCI (class in stats_misc.resampling) summary() (stats_misc.machine_learning.firthlogist.FirthLogisticRegression method) surv_model_auc() (in module stats_misc.machine_learning.sksurv_utils) surv_model_calibration_table() (in module stats_misc.machine_learning.sksurv_utils) surv_model_predict() (in module stats_misc.machine_learning.sksurv_utils) SurvivalModelBrierScore (class in stats_misc.machine_learning.sksurv_utils) SurvivalModelCalibration (class in stats_misc.machine_learning.sksurv_utils)

T

table_recalibrated (stats_misc.machine_learning.validation.RecalibrationResults attribute) tau_squared (stats_misc.meta_analysis.HeterogeneityResults attribute) test_statistic (stats_misc.tests.AnovaTestResults attribute) (stats_misc.tests.TestResults attribute)

TestResults (class in stats_misc.tests) times (stats_misc.machine_learning.sksurv_utils.SurvivalModelBrierScore attribute)

U

univariable_poisson_standard_normal() (in module stats_misc.intervals)

univariable_quantiles_exact() (in module stats_misc.intervals) upper_bound (stats_misc.machine_learning.validation.CstatisticResults attribute)

W

wald_confidence_interval() (in module stats_misc.intervals)

wald_interaction_test() (in module stats_misc.tests)